Bioeletroquímica e Eletrobiotecnologia
Supervisor: Dr. Felipe Conzuelo
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: currículo e pequena entrevista
Deadline: 17 de janeiro 2025
Details: Estudo de processos eletroquímicos que ocorrem no interface entre as moléculas redox e os materiais dos elétrodos, uso de conhecimento adquirido como base para a implementação de dispositivos de base biológica para diversas aplicações. O laboratório toma as enzimas redox como caso central de estudo, pois são os elementos-chave na gestão da energia biológica e são de grande importância para aplicações tecnológicas. São fabricados bioeléctrodos funcionais, constituídos por materiais condutores de eletricidade modificados com enzimas isoladas. Aproveitando ferramentas de caracterização eletroquímica relativamente simples, mas poderosas, são exploradas diferentes estratégias para avaliar a comunicação eletroquímica na interface biótica/abiótica, garantindo que a enzima apropriada realize a imobilização e interação produtiva entre as entidades biológicas e a superfície do elétrodo. Após as suas caracterizações iniciais, os bioeléctrodos implementados serão também investigados quanto ao seu potencial para utilização em aplicações biotecnológicas.
Síntese e aplicação de carbonetos N-heterocíclicos biologicamente relevantes
Supervisor: Dra. Ana Petronilho
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: a ver com o investigador
Aplicações biotecnológicas de metaloproteínas
Supervisor: Dra. Smilja Todorovic
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: currículo e carta de motivação
Deadline: 10 de janeiro de 2025
Details: O projeto de investigação centrar-se-á em oxidorredutases biotecnologicamente relevantes. Serão estudadas as propriedades estruturais e funcionais das metaloenzimas imobilizadas empregando diversas matrizes biocompatíveis, em busca das construções que apresentem o melhor desempenho para a aplicação selecionada.
AI-driven Optical Biology
Supervisor: Dr. Ricardo Henriques
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: Conhecimentos básicos em Python, alguma experiência laboratorial, interesse e motivação demonstrada
Deadline: Fim de Dezembro
Details: O trabalho a desenvolver durante o estágio estará alinhado com um projeto onde desenvolvemos métodos computacionais para análise de imagens de microscopia de bactérias. O estagiário terá oportunidade de trabalhar com ferramentas em python e de inteligência artificial para análise de imagens de super-resolução. Assim como a oportunidade de participar em experiências de microscopia aplicada.
Genetics and Genomics of Plant Complex Traits (PlantX)
Supervisor: Dra. Maria Patto
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: Entrevista
Deadline: 13 de Dezembro
Details: Pode receber até 3 alunos.
Estágio 1 - Melhoramento genético de plantas de feijão (Phaseolus
vulgaris) assistido por marcadores moleculares. Iremos avaliar o perfil
genético de plantas de feijão na geração F1 para verificar o sucesso de
cruzamentos controlados previamente efetuados. Técnicas aplicadas:
extração e quantificação de DNA de plantas, amplificação de sequências
genéticas polimórficas do tipo microssatélite (SSR) por reação em cadeia
da polimerase (PCR), análise dos fragmentos amplificados em géis de
poliacrilamida para comparação do perfil obtido nas plantas F1 com o das
plantas parentais dos cruzamentos.
Estágio 2 - Iremos estudar uma população de 107 linhas de chícharo
(Lathyrus sativus) para explorar a variabilidade agronómica e
nutricional existente e identificar as linhas mais adequadas para a
produção e consumo humano. Para cada linha, serão recolhidos dados
agronómicos, como cor da flor, altura da planta, tempo de floração e
número de sementes, em condições de campo. Perfis nutricionais serão
obtidos utilizando abordagens bioquímicas, nomeadamente através da
extração de compostos, existentes nas sementes, relevantes para o
consumo humano.
Estágio 3 – Otimizar uma técnica de silenciamento de genes em chícharo
(Lathyrus sativus): Virus-Induced Gene Silencing (VIGs). VIGs é uma
tecnologia de genética reversa mediada por RNA utilizada para estudar
função de genes em espécies onde a transformação estável não é possível.
Técnicas aplicada: Transformação de Agrobacterium tumefacies com
vectores de VIGs, expressão transiente em planta e monitorização das
plantas.
Single-molecule study of cell division in mycobacteria
Supervisor: Dr. Zach Hensel
Place of Work: ITQB
Selection Criteria: a ver com o investigador
Bioprocessos celulares
Supervisor: Dra. Inês Isidro
Place of Work: iBET
Selection Criteria: a ver com o investigador
Details: "Aproveitamos o poder da ciência de dados para abordar questões biológicas complexas, combinando aprendizado de máquina e modelos mecanicistas com conjuntos de dados ricos em informações de tecnologias analíticas de processos e ômicas." No envio do email, devem inserir este endereço (internships@ibet.pt) em CC.
Sea toxin
Supervisor: Dr. Pedro Costa
Place of Work: UCIBIO
Selection Criteria: a ver com o investigador
Details: "Nossa missão é entender como os organismos evoluíram para lidar com o estresse sob perspectivas biotecnológicas e de bioconservação, empregando múltiplos modelos biológicos, de animais marinhos a peixes-zebra e murinos. Somos especializados em biologia do estresse, toxicopatologia (especialmente genotoxicologia e histopatologia), “ômicas” e bioinformática."
Engenharia de processos bioquímicos
Supervisor: Dra. Ana Rita Duarte
Place of Work: LAQV
Selection Criteria: a ver com o investigador
Details: "O grupo de pesquisa é distribuído entre vários laboratórios de pesquisa, cuja principal formação científica é Engenharia Química e Bioquímica. Sua pesquisa cobre um amplo espectro de disciplinas, como biocatálise, separação/purificação, solventes e meios de reação, síntese/processamento, biologia de sistemas e modelagem metabólica, e termofísica.”
Bacterial cell surfaces and pathogenesis
Supervisor: Dr. Sérgio Raposo Filipe
Place of Work: UCIBIO
Selection Criteria: entrevista
Details: Construção de fragmentos de DNA capazes de alterar um organismo bacteriano ou levar à expressão de uma proteína com a purificação de componentes bacterianas e sua análise ou com a visualização de organismo bacterianos e quantificação de fenótipos por análise de imagem.
Microbial Stress
Supervisor: Dra. Sofia Pauleta
Place of Work: UCIBIO
Selection Criteria: a ver com o investigador
Benchmarking Novel RNA-Responsive Guide RNA for Tight Regulation of CRISPR-Cas9 Activity / Natural Exosomes as Vehicles for CRISPR-Based Gene Editing/ Chimeric High-Fidelity Cas9 Proteins (3 temas)
Supervisor: Dr. Vasco Barreto
Place of Work: UCIBIO
Selection Criteria: média e entrevista
Deadline: 20 de dezembro de 2024
Proteostase e comunicação intercelular
Supervisor: Dr. Paulo Pereira
Place of Work: CEDOC
Selection Criteria: a ver com o investigador
Molecular and experimental pathology
Supervisor: Dra. Mireia Castillo-Martin
Place of Work: Fundação Champalimaud
Selection Criteria: currículo e entrevista
Deadline: quanto antes para que o laboratório se consiga organizar
Details: “My lab is a pathology lab, in which we are using multispectral microscopy to analyse tumor tissues. If the internship is short, I usually ask the students to mirror one of my students, so that they can learn from them and if they feel confident, can participate in some of the experiments. Since I am also the director of the Biobank, I also have them see the activities that we do as a research infrastructure."
XTAL- Macromolecular Crystallography
Supervisor: Cristiano Mota
Place of Work: UCIBIO
Selection Criteria: N/A
Deadline: até ao final do ano
Details: O estágio será um acompanhamento com hands-on na purificação, caracterização bioquímica e estrutural de PHA sintases de Pseudomonas